Gatunek Escherichia coli jest sklasyfikowany na kategorie lub typy patologiczne na podstawie możliwości produkowania pewnych czynników (markerów) zjadliwości, które są odpowiedzialne za występowanie objawów klinicznych choroby. Wykazano, że u świń prawie wszystkie przypadki biegunek na tle E. coli należą do grupy ETEC, STEC oraz EPEC.
Pierwotnie jałowy przewód pokarmowy noworodka z chwilą narodzin jest zasiedlany przez bakterie, w tym Escherichia coli (E. coli, pałeczka okrężnicy), pochodzących od matki oraz ze środowiska. Escherichia coli szybko staje się częścią naturalnej mikroflory.