Zasadniczo klinicznie zapalenie płuc dzieli się na typowe i atypowe. Typowe oznacza taki stan zapalny, w którym za pomocą badania klinicznego można potwierdzić zapalenie płuc. Atypowe natomiast jest zapaleniem, w którym za pomocą technik badania klinicznego nie jest to możliwe (objawy są skąpe lub ich brak).
Zwykle atypowe zapalenie płuc utożsamia się z śródmiąższowym zapaleniem płuc. Należy zaznaczyć, że podział ten ma swoje korzenie w medycynie ludzkiej, a w związku z tym nie do końca można go stosować w medycynie weterynaryjnej w odniesieniu do przeżuwaczy. Dodatkowo zdarza się, że diagnoza osłuchowa jest niemożliwa w przypadku „normalnego” zapalenia płuc (zmiany zapalne np. są położone zbyt głęboko lub są zbyt małe). Podział patologiczny obejmuje 4 typy zapalenia, które dzielą się one na podtypy.